Run out of- Quedarse sin / Acabarse / Terminarse
Example:
We're running out of milk, can you buy some milk? - Nos estamos quedando sin leche / Se nos está terminando la leche. ¿puedes comprar mas?
What are you running out of ? -¿Qué (cosa) se te esta terminando? / ¿Qué cosa se te está acabando?
Feel free to post your answer.